陆军军医大学第一附属医院眼科始建于1929年，1986年被批准为硕士授予权学科，2000年获国家眼科学博士学位授权点，是国家重点培育学科、军队重点专科、全军眼科学重点实验室、视觉损伤与再生修复重庆市重点实验室、重庆市眼部疾病临床医学研究中心、中国人民解放军西南眼角膜库。

经过九十多年的发展建设，科室已形成一支技术力量雄厚,集医疗、教学、科研为一体的临床学科，现有博士生导师3名、硕士生导师6名,博士以上学历31人，高级职称24人，任省部级以上学术任职52人次，是军内唯一拥有国家杰青和优青(海外)人才的眼科团队。

目前眼科有A、B两个病区，共计病床78张，年门诊量21万余人次，年住院收治9000余人次。科室临床亚专业设置齐全，开展了眼科重点专科所要求的所有专科项目，包括小儿眼科及斜视专业组、眼底病专业组、玻璃体视网膜手术专业组、白内障专业组、角膜病专业组、青光眼专业组、眼眶和泪道疾病专业组、屈光手术专业组、眼视光学专业组、护理学专业组。在严重眼外伤综合救治、干细胞治疗视网膜变性疾病方面居国际领先水平，是国际上首次开展胚胎组织来源的RPC治疗视网膜变性临床试验医疗单位，率先开展hESC-RPE细胞悬液移植治疗黄斑变性的临床试验，率先开展MSC静脉输注治疗糖尿病视网膜病变和视网膜色素变性临床试验。