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研究所集病理学教学、临床病理诊断和科学研究于一体。在国内最早开展临床病理诊断专业病理学教学实践和研究，招收培养了大批高层次病理学专业人才;在神经、胃肠道、淋巴造血、骨及软组织肿瘤等疾病的病理诊断和鉴别诊断方面具有突出优势和特色，临床组织病理诊断每年达五万余例，并接受来自全国的大量疑难病理会诊;形成了以肿瘤血管生成和创伤分子病理研究为特色的重点科研方向，先后主持完成国家及省部级以上等科研课题90余项，发表学术论文600多篇，其中SCI论文70余篇。获得包括国家、军队和重庆市科技成果奖励15项，与美、加、英、法等国家和地区在人员互访、联合培养、合作研究等方面建立了良好的国际合作关系。已成为国内临床病理诊断、病理学基础研究和人才培养的重要基地之一。